Наукове товариство студентів, аспірантів, докторантів і молодих вчених медичного факультету Харківського національного університету імені В.Н. Каразіна існує з 2002 року. Товариство розпочало свою діяльність як Студентське наукове товариство за ініціативи першого декана факультету – Миколи Івановича Яблучанського. Саме завдяки Миколи Івановичу СНТ завдячує своєму розвитку. Перейнявши досвід закордонних колег, головною метою новоствореного товариства стало поклик студентів та їх об'єднання заради розвитку медичної науки.
Першим Головою СНТ медичного факультету став Павло Гарькавий, який займав цю посаду до 2004 року. У 2004 році медичний факультет провів першу Міжнародну наукову конференцію студентів і молодих вчених «Актуальні питання сучасної медицини». В цьому ж році Студентське наукове товариство медичного факультету разом з ще п'ятьма СНТ інших факультетів заснувало Студентське наукове товариство Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна, до складу Правління котрого ввійшли й представники медичного факультету.
З 2004 по 2008 роки посаду Голови Студентського наукового товариства займала Катерина Свідко. В ці роки було засновано доброчинну акцію «Teddy Bear Hospital»: студенти в формі гри допомагають дітям позбутися страху перед лікарями, проводячи зустрічі у дитячих садках, кімнатах по догляду за дітьми.
В 2008-2009 роках Головою Студентського наукового товариства стає Стас Панов. У 2008 році проводиться V Міжнародна наукова конференція студентів і молодих вчених «Актуальні питання сучасної медицини». С кожним роком конференція збирає все більше і більше учасників з України, Росії, Білорусії, Казахстану та інших країн.
В 2009-2010 роках Головою СНТ медичного факультету стає Сергій Кулявець. До цього часу Студентське наукове товариство медичного факультету вже встановило міцні зв'язки з науковими товариствами інших медичних ВНЗ не тільки України, а й інших держав.
З 2010 по 2012 роки посаду Голови Ради СНТ медичного факультету займає Сюзанна Бєлал. Саме в цей час Студентське наукове товариство отримує бурхливий розвиток. До участі у Міжнародній науковій конференції студентів і молодих вчених «Актуальні питання сучасної медицини» приєднуються все більше і більше учасників не тільки ВНЗ і НДІ України, а й багатьох країн зарубіжжя. Проводяться численні зустрічі, кругли столи. Організовуються доброчинні акції по відвідуванню студентами дитячих притулків. Налагоджуються тісні контакти з усіма СНТ медичних ВНЗ України, а також багатьма ВНЗ закордонних держав.
З 2012 року Головою Ради СНТ являється Євген Назаренко. У 2013 році проведено X Міжнародну наукову конференцію студентів і молодих вчених, присвячену 20-річчю медичного факультету Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна «Актуальні питання сучасної медицини». Ця конференція зібрала рекордну кількість учасників з України, Росії, Білорусії, Молдови, Казахстану та Таджикістану. Також в цьому році Студентське наукове товариство медичного факультету ХНУ імені В.Н. Каразіна, разом з представниками декількох інших медичних ВНЗ, організовує активну роботу у напрямку співпраці України з Міжнародною федерацією асоціацій студентів-медиків (IFMSA). Члени СНТ медичного факультету – одні з засновників Всеукраїнської молодіжної асоціації студентів-медиків. У 2014 році, згідно з новим Законом України «Про вищу освіту», а також Положенням Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна про Наукове товариство студентів, аспірантів, докторантів і молодих вчених, СНТ факультету було реорганізоване в Наукове товариство студентів, аспірантів, докторантів і молодих вчених медичного факультету ХНУ імені В.Н. Каразіна, тим самим об'єднавши не тільки студентів, а й усіх молодих вчених, які займаються наукою на факультеті.
2015 року Головою Ради НТМФ було обрано Олену Деліч. В 2018 році Головою Ради НТМФ обрали Дарію Ворону.
Продовжується активна співпраця з Всеукраїнською молодіжною асоціацією студентів-медиків та IFMSA. Проводяться різноманітні соціальні акції, направлені на охорону здоров'я населення. Члени Наукового товариства беруть участь у багатьох міжнародних конференціях та наукових заходах.
Наукове товариство медичного факультету існує вже більше 10-и років. За весь час існування воно об'єднувало різну кількість студентів, але це завжди були достойні, розумні, перспективні, одні з найбільш здібних представників медичного факультету.